資料點顏色
使用不同的顏色來表示不同的資料也是常見的繪圖方式，資料點的顏色是用 col 參數來指定的：
plot(x = Veg$BARESOIL, y = Veg$R, xlab = "Exposed soil", ylab = "Species richness", main = "Scatter plot", xlim = c(0, 45), ylim = c(4, 19), col = 2)
畫出來的圖形為
col 指定的整數會透過 palette 對應到實際使用的顏色，我們可以執行 palette 查看目前的顏色對應：
palette()
預設的輸出為
[1] "black" "red" "green3" "blue" [5] "cyan" "magenta" "yellow" "gray"
編號 1 對應到的顏色是黑色，編號 2 則是紅色，以此類推。另外 col 還可以使用很多種方式指定顏色，詳細說明請參考 par 的線上手冊。
col 跟 pch 的使用方式類似，也都可以靠著向量的方式指定個別資料點的顏色，假設我們要將 1974 年以前的資料用黑色實心的方塊表示，而其餘的資料則用紅色實心的圓圈表示，可以這樣做：
Veg$Time2 <- Veg$Time Veg$Time2 [Veg$Time <= 1974] <- 15 Veg$Time2 [Veg$Time > 1974] <- 16 Veg$Col2 <- Veg$Time Veg$Col2 [Veg$Time <= 1974] <- 1 Veg$Col2 [Veg$Time > 1974] <- 2 plot(x = Veg$BARESOIL, y = Veg$R, xlab = "Exposed soil", ylab = "Species richness", main = "Scatter plot", xlim = c(0, 45), ylim = c(4, 19), pch = Veg$Time2, col = Veg$Col2)
畫出來的圖形為
資料點大小
圖形中資料點的大小可以使用 cex 參數來指定，其預設值是 1，若指定為 2.5 的話，所有的資料點就會變成原來的 2.5 倍大：
plot(x = Veg$BARESOIL, y = Veg$R, xlab = "Exposed soil", ylab = "Species richness", main = "Scatter plot", xlim = c(0, 45), ylim = c(4, 19), pch = 16, cex = 2.5)
畫出來的圖形為
cex 同樣也可以使用向量的方式指定個別的資料點：
Veg$Cex2 <- Veg$Time Veg$Cex2[Veg$Time == 2002] <- 2 Veg$Cex2[Veg$Time != 2002] <- 1 plot(x = Veg$BARESOIL, y = Veg$R, xlab = "Exposed soil", ylab = "Species richness", main = "Scatter plot", xlim = c(0, 45), ylim = c(4, 19), pch = 16, cex = Veg$Cex2)
畫出來的圖形為
