這裡比較 NTFS、FAT32 與 exFAT 這些 Windows 常用的檔案系統，讓您更容易選擇適合自己的檔案系統。
在 Windows 中如果要新增硬碟時，需要進行格式化的動作，這時候必須選擇一個適合自己的檔案系統，如果選擇不恰當，日後很容易造成許多困擾，最常見的狀況就是使用 FAT32 這種舊的檔案系統，當需要儲存超過 4GB 的大檔案時，複製檔案到一半，就出現這樣的錯誤訊息：
這裡顯示「檔案太大無法放置在目的檔案系統」，如果您確定您的硬碟還有足夠的空間，但是卻出現這樣的訊息，就表示問題可能出在檔案系統上，以下是 Windows 系統上常用的檔案系統比較，每一種檔案系統都有它的限制，例如 FAT32 的檔案大小就不能超過 4GB。
| 檔案系統 | FAT32 | NTFS | exFAT（隨身碟專用） |
| 相容性 | 全部 | Windows XP 以後皆可 | Windows 7 以後皆可 Windows XP 需安裝 KB955704 Windows Vista 需要 SP1 或 SP2 |
| 單一檔案大小上限 | 4GB | 16TB（理論值） | 64ZB |
| 磁碟分割區大小上限 | 8TB | 2TB | 16EB |
| 建議分割區大小配置 | 32MB ~ 32GB | 400MB ~ 2TB | 512TB 以下 |
在 Windows 7 中若要格式化硬碟，預設的選項是 FAT32，對一般人而言可能不會有什麼太大的問題，但是如果您會需要儲存大檔案（超過 4GB）的話，就不能用這個選項。
這個問題如果一開始沒有注意到，等到硬碟放了很多東西之後，要再重新格式化就很累了。
因為現在的硬碟容量都非常大，如果是 Windows 個人電腦的內接式硬碟，可以直接選擇 NTFS，而如果是隨身碟或外接式硬碟，則可以考慮使用 exFAT，以現在新的硬碟來說，通常都不適合再使用舊的 FAT32 了。
