介紹如何使用 ParaView 顯示 LAMMPS 分子動力學模擬結果。 安裝 LAMMPS 若在 Ubuntu Linux 中，可以在加入 LAMMPS 相關的套件庫之後，透過 apt 安裝 LAMMPS： # 加入 LAMMPS 相關的套件庫 sudo add-apt-repository ppa:gladky-anton/lammps sudo add-apt-repository ppa:openkim/latest # 更新套件庫資訊 sudo apt-get update # 安裝 LAMMPS sudo apt-get install lammps-stable 安裝完成之後，系統上就會有一個 lmp_stable 執行檔，可以使用 -help 參數查看使用方式。 ...
介紹如何在 R 中使用 ggplot2 的 ggpomological 果樹水彩畫佈景主題繪圖。 ggpomological 果樹水彩畫佈景主題 ggpomological 是一個適用於 ggplot2 繪圖系統的果樹水彩畫佈景主題，其色盤設計來自於美國國家農業圖書館（USDA National Agricultural Library）上面的水彩畫，套用至 ggplot2 的圖形之後，可以讓圖片呈現類似水彩的風格。 ...
介紹如何使用 R 的 ggplot2 套件繪製高品質的長條圖（bar plot）。 基本長條圖 準備資料 在繪製長條圖之前，先準備好類型名稱 type 與數值 value 的對應表： # 準備繪製長條圖的資料 my.df <- data.frame( type = c("A", "B", "C"), value = c(5.6, 7.2, 3.1) ) 查看建立好的資料： ...
介紹如何在 Jupyter 環境中使用 itkwidgets 的棋盤式與並列式影像比較圖，比較兩張 3D 影像的差異。 棋盤式影像比較圖 首先引入 itk 與 itkwidgets 模組，並以 itk 的 imread 讀取影像： import itk import itkwidgets # 以 ITK 讀取兩張影像 image1 = itk.imread("brainweb165a10f17.mha") image2 = itk.imread("brainweb1e1a10f20.mha") 使用 itkwidgets 的 checkerboard 函數可以繪製棋盤式的影像比較圖，其中的 pattern 參數可以用來調整格子的數量，這個數量也可以在互動式的操作介面上調整： ...
介紹如何使用 SimpleITK 的 IntensityWindowingImageFilter 對影像的像素值進行線性轉換。 IntensityWindowingImageFilter 的作用跟 RescaleIntensityImageFilter 類似，差異在於 IntensityWindowingImageFilter 可以自行指定窗函數的數值區間。 相關文章： SimpleITK 使用 RescaleIntensityImageFilter 轉換影像數值範圍教學與範例 ...