itkwidgets 互動式 Jupyter 影像視覺化工具使用教學與範例
介紹如何在 Jupyter 環境中使用 itkwidgets 模組，互動式顯示影像或網格等 3D 資料。 itkwidgets 是從 itk-vtk-viewer 所衍生出來的 Python 模組，可以讓使用者在 Jupyter 環境之下顯示各種影像分析相關的資料。 ...
ITK
Python 使用 SimpleElastix 處理 3D 影像對準教學與範例
介紹如何使用 Python 與 SimpleElastix 處理 3D 影像對準，並顯示處理結果。 Allen Mouse Brain Common Coordinate Framework 第三代的 Allen Mouse Brain Common Coordinate Framework（簡稱 CCFv3）提供了高解析度的老鼠腦圖譜，這裡我們使用 CCFv3 的腦影像作為基準，將自己的腦影像與 CCFv3 的腦影像進行影像對準。 ...
Python 處理 TIFF 三維立體影像降解析度教學與範例
介紹如何在 Python 中使用 ITK 模組處理 TIFF 檔案序列組成的大型影像。 標準處理方式 如果伺服器的記憶體夠大，足夠容納整個影像的話，可以直接一次將整個影像讀取至記憶體，進行各種處理後，再轉存至輸出檔案中。 ...
使用 ITK 與 OpenVDB 將影像轉為 VDB 格式教學與範例
介紹如何使用 ITK 與 OpenVDB 將三維立體影像轉換為 VDB 格式。 ITK 與 OpenVDB 若要將一般的三維立體影像（volume image）轉換為 VDB 格式，可以使用 ITK 函式庫讀取各種三維立體影像，然後再使用 OpenVDB 函式庫轉為 VDB 的檔案格式，以下是基本的實作程式碼。 ...
ITK 影像處理 C++ 程式 Hello World 編譯教學與範例
介紹如何在 Ubuntu Linux 中建立 ITK 應用程式開發環境，撰寫 ITK 的 hello world 程式。 開發環境 若要開發基本的 ITK C++ 應用程式，除了安裝 ITK 函式庫之外，還要安裝好 CMake 編譯工具。在 Ubuntu Linux 中，可以使用 apt 安裝： ...