ITK 使用 TriangleMeshToBinaryImageFilter 將 Surface 轉為二元影像教學與範例

介紹如何使用 ITK 的 TriangleMeshToBinaryImageFilter 將網格(mesh)包圍的範圍轉為二元影像(binary image)。 相關文章: ITK 使用 BinaryMask3DMeshSource 將二元影像轉為 Surface 教學與範例 VTK 使用 vtkDiscreteMarchingCubes 將二元遮罩影像轉為 Mesh 網格教學與範例 ...

September 26, 2020 · G. T. Wang

Python 處理 NumPy、SimpleITK 與 ITK 影像互相轉換教學與範例

介紹如何在 Python 中處理 NumPy、SimpleITK 與 ITK 三種影像格式的互相轉換。 SimpleITK 轉換為 NumPy 與 ITK 若要將 SimpleITK 格式轉換為單純的 NumPy 陣列,可以使用 GetArrayFromImage 或是 GetArrayViewFromImage。 ...

September 24, 2020 · G. T. Wang

SimpleITK 使用 LabelOverlay 套疊標註影像教學與範例

介紹如何使用 SimpleITK 的 LabelOverlay 將標註影像(label image)自動套用色彩後,疊加在原始影像上。 在檢視原始影像與標註影像的對應時,除了用 LabelToRGBImageFilter 將標註影像轉為 RGB 彩色影像之外,也可以利用 LabelOverlay 自動將標註影像轉為 RGB 彩色影像之後,直接疊在原始影像上面。 ...

September 23, 2020 · G. T. Wang

SimpleITK 使用 LabelToRGBImageFilter 將標註影像轉為 RGB 彩色影像教學與範例

介紹如何使用 SimpleITK 的 LabelToRGBImageFilter 將標註影像(label image)轉換為 RGB 彩色影像,方便顯示於螢幕上。 在標註影像的區域時,通常會將標註資訊儲存於另外一個標註檔案(label image)之中,跟原始影像搭配使用,以下是 Allen Mouse Brain CCFv3 平均腦與標註影像的範例。 ...

September 23, 2020 · G. T. Wang

ITK 使用 MeshFileReader 讀取 OBJ 檔案教學與範例

介紹如何使用 ITK 的 MeshFileReader 讀取 OBJ 網格檔案。 Python 讀取 OBJ 檔案 若在 Python 中,可以使用 itk 模組的 MeshFileReader 來讀取 OBJ 檔案: import itk # 設定 Mesh 資料型態(浮點數、維度 3) meshType = itk.Mesh[itk.F, 3] # 建立 Mesh Reader meshReader = itk.MeshFileReader[meshType].New() # 設定 MeshIO meshIO = itk.OBJMeshIO.New() meshReader.SetMeshIO(meshIO) # 指定 OBJ 檔案名稱 meshReader.SetFileName('my_mesh.obj') # 實際讀取 OBJ 檔案 meshReader.Update() # 取得 Mesh 內容 mesh = meshReader.GetOutput() C++ 讀取 OBJ 檔案 若要在 C++ 讀取 OBJ 檔案,可以使用 itk::MeshFileReader: ...

September 7, 2020 · G. T. Wang