ITK 多層級 Multi-Resolution 影像對準架構教學與範例
介紹如何在 ITK 的多層級（multi-resolution）影像對準架構下，進行線性仿射影像對準（affine registration）。 ...
ITK
SimpleITK 使用 IntensityWindowingImageFilter 轉換影像數值範圍教學與範例
介紹如何使用 SimpleITK 的 IntensityWindowingImageFilter 對影像的像素值進行線性轉換。 IntensityWindowingImageFilter 的作用跟 RescaleIntensityImageFilter 類似，差異在於 IntensityWindowingImageFilter 可以自行指定窗函數的數值區間。 相關文章： SimpleITK 使用 RescaleIntensityImageFilter 轉換影像數值範圍教學與範例 ...
Python ITK 3D 剛性影像對準 Rigid Registration 置中初始化教學與範例
介紹如何使用 VersorRigid3DTransform 剛性影像轉換搭配 CenteredTransformInitializer 置中初始化對影像進行對準。 影像對準 首先定義各種資料與物件的型別。 import itk import matplotlib.pyplot as plt # 定義資料型別 FixedImageType = itk.Image[itk.F, 3] MovingImageType = itk.Image[itk.F, 3] TransformType = itk.VersorRigid3DTransform[itk.D] OptimizerType = itk.RegularStepGradientDescentOptimizerv4[itk.D] RegistrationType = itk.ImageRegistrationMethodv4[FixedImageType, MovingImageType] MetricType = itk.MeanSquaresImageToImageMetricv4[FixedImageType, MovingImageType] 建立影像 reader，並指定影像來源檔案： ...
SimpleITK 使用 RescaleIntensityImageFilter 轉換影像數值範圍教學與範例
介紹如何使用 SimpleITK 的 RescaleIntensityImageFilter 對影像的像素值進行線性轉換。 相關文章： SimpleITK 使用 IntensityWindowingImageFilter 轉換影像數值範圍教學與範例 首先從 DICOM 影像序列讀取 3D 影像資料： import SimpleITK as sitk import matplotlib.pyplot as plt # DICOM 影像序列檔案所在目錄 dicom_folder = "/mnt/data/ct_image" # 建立影像序列 Reader reader = sitk.ImageSeriesReader() # 取得所有 DICOM 影像的 Series IDs series_ids = reader.GetGDCMSeriesIDs(dicom_folder) # 取得指定 Series ID 的 DICOM 影像序列檔案名稱 dicom_filenames = reader.GetGDCMSeriesFileNames(dicom_folder, series_ids[]) # 設定 DICOM 影像序列檔案名稱 reader.SetFileNames(dicom_filenames) # 實際讀取影像內容 image = reader.Execute() 確認影像的大小： ...
ITK 使用 BinaryMask3DMeshSource 將二元影像轉為 Surface 教學與範例
介紹如何使用 ITK 的 BinaryMask3DMeshSource 將二元影像（binary image）轉為網格（mesh）構成的 surface。 相關文章： ITK 使用 TriangleMeshToBinaryImageFilter 將 Surface 轉為二元影像教學與範例 VTK 使用 vtkDiscreteMarchingCubes 將二元遮罩影像轉為 Mesh 網格教學與範例 ...