SimpleITK 使用 RescaleIntensityImageFilter 轉換影像數值範圍教學與範例

介紹如何使用 SimpleITK 的 RescaleIntensityImageFilter 對影像的像素值進行線性轉換。 相關文章: SimpleITK 使用 IntensityWindowingImageFilter 轉換影像數值範圍教學與範例 首先從 DICOM 影像序列讀取 3D 影像資料: import SimpleITK as sitk import matplotlib.pyplot as plt # DICOM 影像序列檔案所在目錄 dicom_folder = "/mnt/data/ct_image" # 建立影像序列 Reader reader = sitk.ImageSeriesReader() # 取得所有 DICOM 影像的 Series IDs series_ids = reader.GetGDCMSeriesIDs(dicom_folder) # 取得指定 Series ID 的 DICOM 影像序列檔案名稱 dicom_filenames = reader.GetGDCMSeriesFileNames(dicom_folder, series_ids[]) # 設定 DICOM 影像序列檔案名稱 reader.SetFileNames(dicom_filenames) # 實際讀取影像內容 image = reader.Execute() 確認影像的大小: ...

November 8, 2020 · G. T. Wang

Python SimpleITK 影像處理教學:讀取 DICOM 影像序列檔案

介紹如何使用 Python 的 SimpleITK 模組讀取 DICOM 影像序列檔案,查看後設資料(metadata)、轉存為其他格式的三維影像檔案。 這裡我們使用 DICOM Library 所提供的 CT 影像作為示範,除此之外 ORS 的網站上面也有提供許多可用來測試的影像檔案。 ...

May 25, 2020 · G. T. Wang

Python SimpleITK 影像處理教學:讀取 DICOM 影像後設資料 Metadata

介紹如何在 Python 中使用 SimpleITK 讀取 DICOM 影像的後設資料(metadata)。 許多的醫學影像(例如 X 光、斷層掃描、各種顯微鏡影像等)都會以 DICOM 的格式儲存,而附帶的實驗相關資訊也都會儲存在 DICOM 標準的 Tags 中,以下介紹如何從 DICOM 檔案中取出這些資訊。 ...

April 1, 2020 · G. T. Wang

Python SimpleITK 影像處理教學:基本影像讀取與檢視

介紹如何在 Python 中以 SimpleITK 這套影像處理工具,進行基本的影像讀取與檢視工作。 相關文章: Python SimpleITK 影像處理教學:讀取 DICOM 影像後設資料 Metadata Python SimpleITK 影像處理教學:讀取 DICOM 影像序列檔案 Python 使用 Pydicom 讀取、編輯 DICOM 影像檔案教學與範例 ...

March 31, 2020 · G. T. Wang

Python DICOM 影像分析預處理教學與範例

介紹如何使用 Python 的各種影像相關模組,進行 DICOM 影像分析的預處理(pre-processing)。 讀取 DICOM 影像檔案 若要讀取 DICOM 檔案,可以使用 Pydicom 模組的 dcmread 函數,這裡我們使用 Pydicom 附帶的測試 DICOM 檔案作為示範。 ...

March 29, 2020 · G. T. Wang