SimpleITK 使用 MaskImageFilter 與 MaskNegatedImageFilter 套用遮罩影像教學與範例

介紹如何使用 SimpleITK 的 MaskImageFilter 與 MaskNegatedImageFilter 將遮罩套用至影像中,取出原始影像中對應遮罩標示的區域。 MaskImageFilter 套用遮罩 MaskImageFilter 可以將影像套用指定遮罩,將指定遮罩值的區域篩除。 ...

September 26, 2020 · G. T. Wang

ITK 使用 TriangleMeshToBinaryImageFilter 將 Surface 轉為二元影像教學與範例

介紹如何使用 ITK 的 TriangleMeshToBinaryImageFilter 將網格(mesh)包圍的範圍轉為二元影像(binary image)。 相關文章: ITK 使用 BinaryMask3DMeshSource 將二元影像轉為 Surface 教學與範例 VTK 使用 vtkDiscreteMarchingCubes 將二元遮罩影像轉為 Mesh 網格教學與範例 ...

September 26, 2020 · G. T. Wang

Python 處理 NumPy、SimpleITK 與 ITK 影像互相轉換教學與範例

介紹如何在 Python 中處理 NumPy、SimpleITK 與 ITK 三種影像格式的互相轉換。 SimpleITK 轉換為 NumPy 與 ITK 若要將 SimpleITK 格式轉換為單純的 NumPy 陣列,可以使用 GetArrayFromImage 或是 GetArrayViewFromImage。 ...

September 24, 2020 · G. T. Wang

SimpleITK 使用 LabelOverlay 套疊標註影像教學與範例

介紹如何使用 SimpleITK 的 LabelOverlay 將標註影像(label image)自動套用色彩後,疊加在原始影像上。 在檢視原始影像與標註影像的對應時,除了用 LabelToRGBImageFilter 將標註影像轉為 RGB 彩色影像之外,也可以利用 LabelOverlay 自動將標註影像轉為 RGB 彩色影像之後,直接疊在原始影像上面。 ...

September 23, 2020 · G. T. Wang

SimpleITK 使用 LabelToRGBImageFilter 將標註影像轉為 RGB 彩色影像教學與範例

介紹如何使用 SimpleITK 的 LabelToRGBImageFilter 將標註影像(label image)轉換為 RGB 彩色影像,方便顯示於螢幕上。 在標註影像的區域時,通常會將標註資訊儲存於另外一個標註檔案(label image)之中,跟原始影像搭配使用,以下是 Allen Mouse Brain CCFv3 平均腦與標註影像的範例。 ...

September 23, 2020 · G. T. Wang