
R 主成分與階層式集群分析 HCPC 教學:使用 FactoMineR 套件
介紹如何在 R 中使用 FactoMineR 套件進行主成分與階層式集群分析 HCPC 分析。 群集分析(clustering)是一種在多變量分析中很重要的資料探勘方法,其目的在於依據資料相似度找出適當的分群方式,常見的群集分析有階層式分群(hierarchical clustering)與分割式分群(partitioning clustering,例如 k-means)兩種。 ...

介紹如何在 R 中使用 FactoMineR 套件進行主成分與階層式集群分析 HCPC 分析。 群集分析(clustering)是一種在多變量分析中很重要的資料探勘方法,其目的在於依據資料相似度找出適當的分群方式,常見的群集分析有階層式分群(hierarchical clustering)與分割式分群(partitioning clustering,例如 k-means)兩種。 ...

介紹如何在 Python 中使用 SimpleITK 將一張影像中的部分區域擷取出來,變成一張小的影像。 SimpleITK 的 Extract 與 Crop 函數可以將一張影像中的部分區域擷取出來,儲存成一張小的影像。 ...

本篇記錄請水電師傅來更換抽水馬達與水塔浮球的過程。 我家裡的自來水原本不用抽水馬達就可以自己上到樓頂的水塔,最近自來水廠減壓送水,自來水完全上不去,而抽水馬達可能因為太久沒用所以也壞了,一時之間無水可用,趕緊請附近的水電師傅來換一個新的抽水馬達。 ...

介紹如何在 Python 中使用 SimpleITK 的 Shrink 函數來縮小影像。 顯示影像切面函數 首先定義一個用來顯示影像切面的函數: import SimpleITK as sitk import matplotlib.pyplot as plt # 顯示影像切面 def myShowImage(image, z_index): nda = sitk.GetArrayViewFromImage(image) slice = nda[z_index,:,:] plt.imshow(slice) plt.show() 原始影像 這裡我們以 Allen Mouse Brain Atlas 老鼠標準腦的影像為範例,先讀取原始影像,並檢查其影像大小、位置與 voxel size 資訊。 ...

介紹如何在 Python 中使用 SimpleITK 將一張影像貼在另外一張影像中。 SimpleITK 的 Paste 函數可以將一張影像貼在另外一張影像中指定的位置,將原本的影像蓋過去。 在影像對準的應用中,我們可以利用這樣的方式擴展基準影像的邊界,方便進行後續的影像對準工作。 ...