Python SimpleITK 影像處理教學：Extract、Crop、RegionOfInterest 擷取部分影像
介紹如何在 Python 中使用 SimpleITK 將一張影像中的部分區域擷取出來，變成一張小的影像。 SimpleITK 的 Extract 與 Crop 函數可以將一張影像中的部分區域擷取出來，儲存成一張小的影像。 ...
Python
Python SimpleITK 影像處理教學：Shrink 縮小影像
介紹如何在 Python 中使用 SimpleITK 的 Shrink 函數來縮小影像。 顯示影像切面函數 首先定義一個用來顯示影像切面的函數： import SimpleITK as sitk import matplotlib.pyplot as plt # 顯示影像切面 def myShowImage(image, z_index): nda = sitk.GetArrayViewFromImage(image) slice = nda[z_index,:,:] plt.imshow(slice) plt.show() 原始影像 這裡我們以 Allen Mouse Brain Atlas 老鼠標準腦的影像為範例，先讀取原始影像，並檢查其影像大小、位置與 voxel size 資訊。 ...
Python SimpleITK 影像處理教學：Paste 貼上影像
介紹如何在 Python 中使用 SimpleITK 將一張影像貼在另外一張影像中。 SimpleITK 的 Paste 函數可以將一張影像貼在另外一張影像中指定的位置，將原本的影像蓋過去。 在影像對準的應用中，我們可以利用這樣的方式擴展基準影像的邊界，方便進行後續的影像對準工作。 ...
Python SimpleITK 影像處理教學：Allen Mouse Brain Atlas 老鼠標準腦
介紹如何在 Python 以 SimpleITK 模組讀取 Allen Mouse Brain Atlas 老鼠標準腦、繪製切面圖，並計算各種基本統計量。 讀取標準腦影像 老鼠的標準腦 volume 影像可從 Allen Mouse Brain Atlas 的網站 下載，解壓縮之後即可使用 Python 的 SimpleITK 模組來讀取： ...
讀取 IMARIS（IMS）檔案原始影像、後設資料教學與範例
介紹如何從 IMS 檔案中讀取影像資料，轉換成其他的影像檔案。 IMARIS（IMS）是一種以 HDF5 格式為基礎的影像檔案格式，專門用於儲存大型的影像，在一個 IMS 影像檔案中除了原始解析度的影像之外，同時也會包含低解析度的影像資料，配合 HDF5 的 chunk 方式儲存，可加速影像的讀取與顯示速度。 ...