SimpleITK 使用 LabelOverlay 套疊標註影像教學與範例
介紹如何使用 SimpleITK 的 LabelOverlay 將標註影像（label image）自動套用色彩後，疊加在原始影像上。 在檢視原始影像與標註影像的對應時，除了用 LabelToRGBImageFilter 將標註影像轉為 RGB 彩色影像之外，也可以利用 LabelOverlay 自動將標註影像轉為 RGB 彩色影像之後，直接疊在原始影像上面。 ...
Python
SimpleITK 使用 LabelToRGBImageFilter 將標註影像轉為 RGB 彩色影像教學與範例
介紹如何使用 SimpleITK 的 LabelToRGBImageFilter 將標註影像（label image）轉換為 RGB 彩色影像，方便顯示於螢幕上。 在標註影像的區域時，通常會將標註資訊儲存於另外一個標註檔案（label image）之中，跟原始影像搭配使用，以下是 Allen Mouse Brain CCFv3 平均腦與標註影像的範例。 ...
ITK 使用 MeshFileReader 讀取 OBJ 檔案教學與範例
介紹如何使用 ITK 的 MeshFileReader 讀取 OBJ 網格檔案。 Python 讀取 OBJ 檔案 若在 Python 中，可以使用 itk 模組的 MeshFileReader 來讀取 OBJ 檔案： import itk # 設定 Mesh 資料型態（浮點數、維度 3） meshType = itk.Mesh[itk.F, 3] # 建立 Mesh Reader meshReader = itk.MeshFileReader[meshType].New() # 設定 MeshIO meshIO = itk.OBJMeshIO.New() meshReader.SetMeshIO(meshIO) # 指定 OBJ 檔案名稱 meshReader.SetFileName('my_mesh.obj') # 實際讀取 OBJ 檔案 meshReader.Update() # 取得 Mesh 內容 mesh = meshReader.GetOutput() C++ 讀取 OBJ 檔案 若要在 C++ 讀取 OBJ 檔案，可以使用 itk::MeshFileReader： ...
itkwidgets 互動式 Jupyter 影像視覺化工具使用教學與範例
介紹如何在 Jupyter 環境中使用 itkwidgets 模組，互動式顯示影像或網格等 3D 資料。 itkwidgets 是從 itk-vtk-viewer 所衍生出來的 Python 模組，可以讓使用者在 Jupyter 環境之下顯示各種影像分析相關的資料。 ...
Python 使用 SimpleElastix 處理 3D 影像對準教學與範例
介紹如何使用 Python 與 SimpleElastix 處理 3D 影像對準，並顯示處理結果。 Allen Mouse Brain Common Coordinate Framework 第三代的 Allen Mouse Brain Common Coordinate Framework（簡稱 CCFv3）提供了高解析度的老鼠腦圖譜，這裡我們使用 CCFv3 的腦影像作為基準，將自己的腦影像與 CCFv3 的腦影像進行影像對準。 ...